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首页 > 拜谱生物 > 干货分享 > 在线药剂学学论述草酸钙肾结石硫化应激性和发炎挫伤管理机制

网络药理学揭示草酸钙肾结石氧化应激和炎症损伤机制

发布时间:2024-08-02
草酸钙(CaOx)肾结石是泌尿控制软件最喜欢见的常见疾病最为。肾策划 中CaOx晶胞过趋于稳定磨合会造成肾小管内部拉伤和凋亡,而造成肾结石的达成。短链肌肉酸由肠内内活性污泥病菌发酵法营养健康氯纶存在,往往在高斯模糊肠内防线中激发效应,况且在控制软件能力上也激发关键因素效应。这之中,丁酸是最丰富的的短链肌肉酸,体现了抗感染和天然免疫可以抑制效应,本论述一起探讨丁酸对CaOx肾结石的效应以至于风险靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究,华山诊所泌尿五官科吴忠讲师、周子健院士于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果,7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠专家、周子健医生在Food and Chemical Toxicology(IF=4.3)上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤,并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因,最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱动物与吴忠教授、周子健博士团队再次合作,提供了数据网络药理学学售后服务,助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点,为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

论文明称:Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9(Food Chem Toxicol.,IF=4.3,2023.07) 加盟商基层单位:华山医院门诊 论述的对象:大鼠、HK-2神经细胞 分类新信息:相较比较组(Con)、3d模型组(Model)和丁酸钠组(NaB) 拜谱保证的技术:网络信息药学学检侧

指导思想方案图

理论研究结果显示

探析人员管理先构筑大鼠模形,顺利通过人体生理生化学指标值和聚集病理学学固色等探析行为察觉到丁酸都可以极大减少CaOx模形大鼠肾CaOx多晶体的养成和软组织受伤,解决CaOx模形大鼠的支原体感染软组织受伤和钝化类物质的无限传达。与此同时,丁酸还可抑止草酸诱惑的HK-2神经体细胞软组织受伤、钝化应激状态和神经体细胞凋亡。 为探索丁酸的格局和靶什么是DNA线上,论述员工从PubChem获取一个丁酸和丁酸酯的二维和二维的格局(图1A)。完成PharmMapper统计资料库和Uniprot统计资料库治理 后共建立出114个丁酸靶什么是DNA供进一个步骤讲解。将什么是DNA下拉列表倒入STRING统计资料库,使用PPI线上讲解。Cytoscape求出了排列的前20的核心靶什么是DNA的详细完整线上图,还有CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2(图1B)。等核心什么是DNA与线上中的另外的什么是DNA均表面出务必的涉及到性,证明等什么是DNA几率充分起着着联动效用。GO和KEGG讲解阐明了丁酸核心什么是DNA的涉及到方式和生态学学能力(图1C)。核心什么是DNA主耍与类固醇刺抗生素回话、钝化应激反應发应回话、特异性氧生殖细胞对类固醇刺抗生素条件刺激的发应及其对含酸性物理化学类物质的发应相关的英文。以上指出,等核心什么是DNA主耍参与活动了钝化应激反應发应和对特异性氧的生态学发应阶段,是肾结石出现逻辑中更重要性性的方式,这意味着丁酸几率在肾结石中充分起着更重要性效用。

图1| 丁酸组成与靶染色体无线网络剖析(图源:Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进三步探求丁酸对CaOx肾结石真的切靶dna,论述师凭借GEO统计资料库对GSE73680中绿色健康对应与CaOx肾结石病号的dna一定的差异实现了论述。对应组与CaOx结石病号的同质性性一定的差异表示dna(DEGs)塞查标准的为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共建立到3783个dna时有发生同质性不良影响,这之中3379个(89.4%)dna表示调涨,404个(10.6%)dna表示下跌(图2A)。对DEGs实现聚类分析阐述阐述,热图展现了前10个被选中DEGs的二维分段聚类分析阐述基本特征(图2B)。随即,论述师顺利通过GeneCards统计资料库人工客服电话亲子鉴定了370个将与CaOx肾结石相关内容联的dna,排名就前20位的预测分析dna十分相关内容联性评价如下图提示2C提示。主要在于查找丁酸治疗方法CaOx肾结石的主要靶点,论述师将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石相关内容联dna解决实现了一大个Venn图。终结,CYP2C9被确保为丁酸不良影响CaOx肾结石的隐藏的靶点(图2D)。还有就是,论述师还实现了丁酸与CYP2C9的氧分子接管,CYP2C9的6个有机酸残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸彼此之间效用,氢键能为4.2 kcal/mol(图2E)。 在合理利用网路药剂学学預测CYP2C9是丁酸影响到CaOx肾结石的靶基因组后,设计的人员还顺利通过内部实验报告印证了CYP2C9可减轻草酸诱导性的HK-2内部的ROS关卡、疾病伤到和凋亡。

图2| 而言据库连合讲解预测分析CYP2C9是丁酸能力于CaOx肾结石的靶dna

探究数据

本学习应当出现丁酸在休外和人体均能减缓CaOx肾结石建模方法的防氧化物应激反应性和感染直接伤到,在最后依据无线网格药剂学学选择得见丁酸影晌CaOx肾结石的自身靶点——CYP2C9,在最后依据组织内部实验英文核实CYP2C9在草酸盐促进的HK-2组织内部ROS水平方向、感染直接伤到和凋亡。等等出现取决于丁酸可能性依据减缓CYP2C9来减缓CaOx肾结石的防氧化物应激反应性,减少感染直接伤到。这样步骤中拜谱生物制品体出示了无线网格药剂学学科技性精准服务质量,再者拜谱生物制品体可增强较为成熟加强制度建设的基因组组学、核膳食纤维组学、新陈代谢组学等几组学品牌及科技性精准服务质量,喜欢致电的方式咨讯! 关联性专著:Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.
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